職場、居住地域、学園などに、3人以上の党員で「支部」を形成（労働運動、女性運動などの専従者・役員は支部の代わりに「グループ」を形成）。かつて「支部」は「細胞」と呼ばれていた。支部は「党の基礎組織」とし、支部 - 地区 - 都道府県 - 中央の形で縦割りに組織している。各級は党会議あるいは総会により、指導機関である「委員会」（支部は「支部長」の場合もある）を選出する。
「支部」は、企業・団体内につくられるもの（職場支部、労組グループ、婦人運動グループなど）から、市町村などの区域内をいくつかにわけた各地単位（地域支部、居住支部）、大学などに通う学生単位（学園支部）、更には階層ごとに組織されるもの（青年支部[9]、複数の学校にまたがる学生支部など）など、様々な形態で存在する。居住地域の「支部」は、他の政党には見られないきめ細かさで、都市部では比較的身近に存在し、議員主体の政党でない同党の特徴と言える。
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「地区」は、東京都23区では特別区単位で存在し、人口と党員の少ない地域では、県を2?3つにわけた程度の広範囲の名称を冠する「地区」も存在する。
トヨタ自動車や東京大学など多くの党員を抱える職場・学園、一つの市町村区域内に2つ以上の支部がある場合、地方議員を抱える場合などに補助機関として「委員会」が組織されている（党規約[10][11]など）。